Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cpne9Q1RLL3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Cpne9Q1RLL3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cpne9Q1RLL3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cpne9Q1RLL3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cpne9Q1RLL3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cpne9Q1RLL3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cpne9Q1RLL3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cpne9Q1RLL3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cpne9Q1RLL3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cpne9Q1RLL3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cpne9Q1RLL3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cpne9Q1RLL3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cpne9Q1RLL3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cpne9Q1RLL3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cpne9Q1RLL3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cpne9Q1RLL3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cpne9Q1RLL3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cpne9Q1RLL3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cpne9Q1RLL3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Cpne9Q1RLL3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cpne9Q1RLL3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cpne9Q1RLL3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cpne9Q1RLL3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cpne9Q1RLL3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cpne9Q1RLL3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cpne9Q1RLL3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cpne9Q1RLL3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cpne9Q1RLL3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cpne9Q1RLL3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms