Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHW4

Sap25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap25Q1EHW4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sap25Q1EHW4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Sap25Q1EHW4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sap25Q1EHW4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms