Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc162pQ0VG85 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc162pQ0VG85 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc162pQ0VG85 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc162pQ0VG85 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc162pQ0VG85 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc162pQ0VG85 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc162pQ0VG85 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc162pQ0VG85 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc162pQ0VG85 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc162pQ0VG85 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc162pQ0VG85 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc162pQ0VG85 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc162pQ0VG85 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc162pQ0VG85 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc162pQ0VG85 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc162pQ0VG85 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc162pQ0VG85 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc162pQ0VG85 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc162pQ0VG85 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc162pQ0VG85 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc162pQ0VG85 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc162pQ0VG85 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc162pQ0VG85 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc162pQ0VG85 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc162pQ0VG85 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc162pQ0VG85 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc162pQ0VG85 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc162pQ0VG85 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc162pQ0VG85 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc162pQ0VG85 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc162pQ0VG85 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc162pQ0VG85 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc162pQ0VG85 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc162pQ0VG85 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc162pQ0VG85 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc162pQ0VG85 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc162pQ0VG85 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc162pQ0VG85 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms