Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Znf541Q0GGX2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Znf541Q0GGX2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Znf541Q0GGX2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Znf541Q0GGX2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Znf541Q0GGX2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Znf541Q0GGX2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Znf541Q0GGX2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Znf541Q0GGX2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Znf541Q0GGX2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Znf541Q0GGX2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Znf541Q0GGX2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Znf541Q0GGX2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Znf541Q0GGX2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Znf541Q0GGX2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Znf541Q0GGX2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Znf541Q0GGX2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Znf541Q0GGX2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Znf541Q0GGX2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Znf541Q0GGX2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Znf541Q0GGX2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Znf541Q0GGX2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Znf541Q0GGX2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Znf541Q0GGX2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Znf541Q0GGX2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Znf541Q0GGX2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Znf541Q0GGX2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Znf541Q0GGX2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Znf541Q0GGX2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Znf541Q0GGX2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Znf541Q0GGX2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Znf541Q0GGX2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Znf541Q0GGX2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Znf541Q0GGX2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Znf541Q0GGX2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Znf541Q0GGX2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Znf541Q0GGX2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Znf541Q0GGX2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Znf541Q0GGX2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Znf541Q0GGX2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Znf541Q0GGX2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Znf541Q0GGX2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Znf541Q0GGX2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Znf541Q0GGX2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Znf541Q0GGX2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Znf541Q0GGX2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Znf541Q0GGX2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Znf541Q0GGX2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Znf541Q0GGX2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
Znf541Q0GGX2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Znf541Q0GGX2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Znf541Q0GGX2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Znf541Q0GGX2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Znf541Q0GGX2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Znf541Q0GGX2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Znf541Q0GGX2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Znf541Q0GGX2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Znf541Q0GGX2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Znf541Q0GGX2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Znf541Q0GGX2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Znf541Q0GGX2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Znf541Q0GGX2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Znf541Q0GGX2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Znf541Q0GGX2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Znf541Q0GGX2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Znf541Q0GGX2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Znf541Q0GGX2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Znf541Q0GGX2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Znf541Q0GGX2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Znf541Q0GGX2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Znf541Q0GGX2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Znf541Q0GGX2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Znf541Q0GGX2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Znf541Q0GGX2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Znf541Q0GGX2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Znf541Q0GGX2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Znf541Q0GGX2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Znf541Q0GGX2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Znf541Q0GGX2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Znf541Q0GGX2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Znf541Q0GGX2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Znf541Q0GGX2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Znf541Q0GGX2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Znf541Q0GGX2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Znf541Q0GGX2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Znf541Q0GGX2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Znf541Q0GGX2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Znf541Q0GGX2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Znf541Q0GGX2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Znf541Q0GGX2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Znf541Q0GGX2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Znf541Q0GGX2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms