Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ebf1Q07802 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ebf1Q07802 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ebf1Q07802 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ebf1Q07802 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ebf1Q07802 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ebf1Q07802 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ebf1Q07802 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ebf1Q07802 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ebf1Q07802 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ebf1Q07802 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ebf1Q07802 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ebf1Q07802 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ebf1Q07802 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ebf1Q07802 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ebf1Q07802 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ebf1Q07802 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ebf1Q07802 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ebf1Q07802 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ebf1Q07802 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms