Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sox10Q04888 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sox10Q04888 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox10Q04888 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox10Q04888 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox10Q04888 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox10Q04888 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox10Q04888 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sox10Q04888 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sox10Q04888 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sox10Q04888 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sox10Q04888 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sox10Q04888 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sox10Q04888 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sox10Q04888 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Sox10Q04888 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sox10Q04888 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sox10Q04888 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sox10Q04888 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sox10Q04888 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Sox10Q04888 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sox10Q04888 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sox10Q04888 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sox10Q04888 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sox10Q04888 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sox10Q04888 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sox10Q04888 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sox10Q04888 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sox10Q04888 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sox10Q04888 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sox10Q04888 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sox10Q04888 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sox10Q04888 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sox10Q04888 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sox10Q04888 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sox10Q04888 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sox10Q04888 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sox10Q04888 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sox10Q04888 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sox10Q04888 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sox10Q04888 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sox10Q04888 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sox10Q04888 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Sox10Q04888 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sox10Q04888 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sox10Q04888 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sox10Q04888 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sox10Q04888 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sox10Q04888 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sox10Q04888 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sox10Q04888 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sox10Q04888 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sox10Q04888 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms