Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox8Q04886 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox8Q04886 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox8Q04886 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox8Q04886 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox8Q04886 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox8Q04886 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox8Q04886 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox8Q04886 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox8Q04886 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox8Q04886 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox8Q04886 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox8Q04886 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sox8Q04886 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sox8Q04886 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sox8Q04886 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox8Q04886 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox8Q04886 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox8Q04886 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox8Q04886 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox8Q04886 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox8Q04886 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox8Q04886 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox8Q04886 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox8Q04886 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox8Q04886 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox8Q04886 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox8Q04886 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox8Q04886 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox8Q04886 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox8Q04886 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox8Q04886 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox8Q04886 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox8Q04886 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox8Q04886 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox8Q04886 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox8Q04886 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox8Q04886 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox8Q04886 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox8Q04886 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox8Q04886 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox8Q04886 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox8Q04886 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox8Q04886 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox8Q04886 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox8Q04886 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox8Q04886 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox8Q04886 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox8Q04886 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox8Q04886 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox8Q04886 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox8Q04886 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sox8Q04886 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sox8Q04886 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox8Q04886 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox8Q04886 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox8Q04886 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox8Q04886 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox8Q04886 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox8Q04886 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox8Q04886 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox8Q04886 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox8Q04886 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox8Q04886 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox8Q04886 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox8Q04886 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox8Q04886 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox8Q04886 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox8Q04886 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox8Q04886 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox8Q04886 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox8Q04886 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox8Q04886 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox8Q04886 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox8Q04886 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox8Q04886 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox8Q04886 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox8Q04886 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox8Q04886 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox8Q04886 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox8Q04886 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox8Q04886 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox8Q04886 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox8Q04886 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox8Q04886 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox8Q04886 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sox8Q04886 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox8Q04886 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox8Q04886 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox8Q04886 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox8Q04886 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox8Q04886 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox8Q04886 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox8Q04886 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox8Q04886 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox8Q04886 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox8Q04886 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox8Q04886 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox8Q04886 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox8Q04886 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms