Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrcdQ00LT2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.1 ms