Protein–RNA interactions for Protein: P97858

Slc35b1, Solute carrier family 35 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35b1P97858 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc35b1P97858 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc35b1P97858 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc35b1P97858 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc35b1P97858 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc35b1P97858 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc35b1P97858 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc35b1P97858 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc35b1P97858 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc35b1P97858 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc35b1P97858 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc35b1P97858 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc35b1P97858 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc35b1P97858 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc35b1P97858 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc35b1P97858 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc35b1P97858 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc35b1P97858 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc35b1P97858 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc35b1P97858 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc35b1P97858 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc35b1P97858 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc35b1P97858 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc35b1P97858 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc35b1P97858 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc35b1P97858 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc35b1P97858 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc35b1P97858 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc35b1P97858 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc35b1P97858 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc35b1P97858 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc35b1P97858 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc35b1P97858 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc35b1P97858 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc35b1P97858 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc35b1P97858 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc35b1P97858 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc35b1P97858 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc35b1P97858 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc35b1P97858 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc35b1P97858 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc35b1P97858 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc35b1P97858 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc35b1P97858 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc35b1P97858 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc35b1P97858 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc35b1P97858 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc35b1P97858 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc35b1P97858 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms