Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gata5P97489 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gata5P97489 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gata5P97489 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gata5P97489 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gata5P97489 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gata5P97489 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gata5P97489 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gata5P97489 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gata5P97489 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gata5P97489 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gata5P97489 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms