Protein–RNA interactions for Protein: P97436

Nkx3-1, Homeobox protein Nkx-3.1, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx3-1P97436 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx3-1P97436 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx3-1P97436 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx3-1P97436 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx3-1P97436 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx3-1P97436 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx3-1P97436 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx3-1P97436 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx3-1P97436 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx3-1P97436 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx3-1P97436 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx3-1P97436 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx3-1P97436 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx3-1P97436 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx3-1P97436 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx3-1P97436 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx3-1P97436 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx3-1P97436 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx3-1P97436 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nkx3-1P97436 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx3-1P97436 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx3-1P97436 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkx3-1P97436 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx3-1P97436 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx3-1P97436 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx3-1P97436 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx3-1P97436 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx3-1P97436 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx3-1P97436 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx3-1P97436 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx3-1P97436 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkx3-1P97436 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx3-1P97436 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx3-1P97436 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx3-1P97436 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx3-1P97436 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx3-1P97436 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx3-1P97436 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx3-1P97436 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkx3-1P97436 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx3-1P97436 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx3-1P97436 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx3-1P97436 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx3-1P97436 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx3-1P97436 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx3-1P97436 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx3-1P97436 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx3-1P97436 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx3-1P97436 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkx3-1P97436 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx3-1P97436 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx3-1P97436 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx3-1P97436 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx3-1P97436 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkx3-1P97436 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms