Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nkx2-3P97334 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nkx2-3P97334 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nkx2-3P97334 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nkx2-3P97334 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Nkx2-3P97334 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nkx2-3P97334 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nkx2-3P97334 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nkx2-3P97334 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nkx2-3P97334 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nkx2-3P97334 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nkx2-3P97334 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nkx2-3P97334 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nkx2-3P97334 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nkx2-3P97334 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nkx2-3P97334 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nkx2-3P97334 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nkx2-3P97334 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nkx2-3P97334 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nkx2-3P97334 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nkx2-3P97334 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nkx2-3P97334 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nkx2-3P97334 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nkx2-3P97334 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nkx2-3P97334 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Nkx2-3P97334 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nkx2-3P97334 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nkx2-3P97334 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nkx2-3P97334 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nkx2-3P97334 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nkx2-3P97334 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nkx2-3P97334 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nkx2-3P97334 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nkx2-3P97334 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nkx2-3P97334 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nkx2-3P97334 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nkx2-3P97334 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nkx2-3P97334 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nkx2-3P97334 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nkx2-3P97334 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nkx2-3P97334 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Nkx2-3P97334 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Nkx2-3P97334 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nkx2-3P97334 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nkx2-3P97334 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nkx2-3P97334 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nkx2-3P97334 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Nkx2-3P97334 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nkx2-3P97334 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nkx2-3P97334 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nkx2-3P97334 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nkx2-3P97334 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nkx2-3P97334 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nkx2-3P97334 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nkx2-3P97334 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nkx2-3P97334 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nkx2-3P97334 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nkx2-3P97334 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Nkx2-3P97334 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nkx2-3P97334 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nkx2-3P97334 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nkx2-3P97334 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nkx2-3P97334 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nkx2-3P97334 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nkx2-3P97334 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Nkx2-3P97334 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Nkx2-3P97334 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nkx2-3P97334 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nkx2-3P97334 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nkx2-3P97334 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nkx2-3P97334 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nkx2-3P97334 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nkx2-3P97334 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nkx2-3P97334 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nkx2-3P97334 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nkx2-3P97334 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nkx2-3P97334 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nkx2-3P97334 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Nkx2-3P97334 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nkx2-3P97334 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nkx2-3P97334 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Nkx2-3P97334 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nkx2-3P97334 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nkx2-3P97334 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Nkx2-3P97334 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Nkx2-3P97334 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nkx2-3P97334 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nkx2-3P97334 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nkx2-3P97334 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nkx2-3P97334 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nkx2-3P97334 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nkx2-3P97334 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nkx2-3P97334 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nkx2-3P97334 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nkx2-3P97334 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nkx2-3P97334 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nkx2-3P97334 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nkx2-3P97334 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nkx2-3P97334 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nkx2-3P97334 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms