Protein–RNA interactions for Protein: P84751

Ig heavy chain Mem5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P84751 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P84751 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P84751 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P84751 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P84751 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P84751 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P84751 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P84751 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P84751 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P84751 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P84751 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P84751 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P84751 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P84751 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P84751 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P84751 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P84751 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P84751 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P84751 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P84751 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P84751 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P84751 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P84751 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P84751 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P84751 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P84751 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P84751 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P84751 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P84751 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P84751 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P84751 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P84751 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P84751 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P84751 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P84751 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P84751 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P84751 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P84751 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P84751 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P84751 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P84751 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P84751 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P84751 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P84751 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P84751 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P84751 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P84751 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P84751 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P84751 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P84751 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P84751 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P84751 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P84751 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P84751 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P84751 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P84751 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P84751 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P84751 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P84751 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P84751 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P84751 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P84751 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P84751 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P84751 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P84751 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P84751 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P84751 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P84751 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P84751 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P84751 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P84751 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P84751 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P84751 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P84751 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P84751 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P84751 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P84751 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P84751 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P84751 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P84751 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P84751 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P84751 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P84751 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P84751 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P84751 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P84751 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P84751 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P84751 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P84751 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P84751 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P84751 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P84751 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P84751 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P84751 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P84751 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P84751 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P84751 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P84751 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P84751 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P84751 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms