Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irx3P81067 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irx3P81067 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Irx3P81067 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irx3P81067 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Irx3P81067 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Irx3P81067 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Irx3P81067 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Irx3P81067 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Irx3P81067 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Irx3P81067 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Irx3P81067 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Irx3P81067 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Irx3P81067 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Irx3P81067 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Irx3P81067 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Irx3P81067 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Irx3P81067 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Irx3P81067 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Irx3P81067 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Irx3P81067 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Irx3P81067 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Irx3P81067 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Irx3P81067 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Irx3P81067 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Irx3P81067 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Irx3P81067 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irx3P81067 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irx3P81067 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irx3P81067 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irx3P81067 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irx3P81067 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irx3P81067 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irx3P81067 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irx3P81067 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irx3P81067 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irx3P81067 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irx3P81067 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Irx3P81067 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Irx3P81067 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Irx3P81067 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Irx3P81067 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Irx3P81067 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Irx3P81067 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Irx3P81067 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Irx3P81067 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Irx3P81067 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Irx3P81067 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Irx3P81067 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Irx3P81067 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Irx3P81067 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Irx3P81067 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Irx3P81067 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Irx3P81067 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Irx3P81067 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Irx3P81067 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Irx3P81067 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Irx3P81067 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Irx3P81067 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Irx3P81067 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Irx3P81067 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Irx3P81067 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Irx3P81067 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Irx3P81067 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Irx3P81067 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.9 ms