Protein–RNA interactions for Protein: P70663

Sparcl1, SPARC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sparcl1P70663 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sparcl1P70663 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sparcl1P70663 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sparcl1P70663 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sparcl1P70663 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sparcl1P70663 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sparcl1P70663 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sparcl1P70663 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sparcl1P70663 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sparcl1P70663 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sparcl1P70663 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sparcl1P70663 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sparcl1P70663 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sparcl1P70663 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sparcl1P70663 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sparcl1P70663 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sparcl1P70663 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sparcl1P70663 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sparcl1P70663 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sparcl1P70663 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sparcl1P70663 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sparcl1P70663 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sparcl1P70663 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sparcl1P70663 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sparcl1P70663 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sparcl1P70663 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sparcl1P70663 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sparcl1P70663 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sparcl1P70663 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sparcl1P70663 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sparcl1P70663 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sparcl1P70663 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sparcl1P70663 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sparcl1P70663 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sparcl1P70663 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sparcl1P70663 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sparcl1P70663 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sparcl1P70663 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sparcl1P70663 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sparcl1P70663 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sparcl1P70663 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sparcl1P70663 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sparcl1P70663 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms