Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkn1P70268 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkn1P70268 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkn1P70268 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkn1P70268 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkn1P70268 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkn1P70268 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkn1P70268 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkn1P70268 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkn1P70268 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkn1P70268 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkn1P70268 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkn1P70268 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkn1P70268 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkn1P70268 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkn1P70268 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkn1P70268 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkn1P70268 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkn1P70268 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkn1P70268 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkn1P70268 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkn1P70268 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkn1P70268 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkn1P70268 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkn1P70268 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkn1P70268 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkn1P70268 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkn1P70268 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkn1P70268 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkn1P70268 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkn1P70268 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkn1P70268 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkn1P70268 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkn1P70268 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkn1P70268 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkn1P70268 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkn1P70268 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkn1P70268 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkn1P70268 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkn1P70268 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkn1P70268 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkn1P70268 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkn1P70268 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkn1P70268 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkn1P70268 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkn1P70268 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkn1P70268 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkn1P70268 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkn1P70268 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkn1P70268 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkn1P70268 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkn1P70268 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkn1P70268 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkn1P70268 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkn1P70268 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkn1P70268 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkn1P70268 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkn1P70268 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkn1P70268 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkn1P70268 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkn1P70268 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkn1P70268 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkn1P70268 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms