Protein–RNA interactions for Protein: P70248

Myo1f, Unconventional myosin-If, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1fP70248 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myo1fP70248 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myo1fP70248 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myo1fP70248 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myo1fP70248 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo1fP70248 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo1fP70248 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo1fP70248 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo1fP70248 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo1fP70248 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo1fP70248 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo1fP70248 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo1fP70248 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo1fP70248 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo1fP70248 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo1fP70248 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo1fP70248 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo1fP70248 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo1fP70248 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo1fP70248 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo1fP70248 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo1fP70248 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo1fP70248 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Myo1fP70248 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Myo1fP70248 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Myo1fP70248 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Myo1fP70248 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Myo1fP70248 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myo1fP70248 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myo1fP70248 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myo1fP70248 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myo1fP70248 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myo1fP70248 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myo1fP70248 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Myo1fP70248 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Myo1fP70248 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Myo1fP70248 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Myo1fP70248 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Myo1fP70248 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Myo1fP70248 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Myo1fP70248 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Myo1fP70248 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Myo1fP70248 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Myo1fP70248 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Myo1fP70248 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms