Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrig1P70193 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrig1P70193 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrig1P70193 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms