Protein–RNA interactions for Protein: P70190

Capza3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza3P70190 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capza3P70190 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capza3P70190 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capza3P70190 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capza3P70190 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capza3P70190 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capza3P70190 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capza3P70190 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capza3P70190 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capza3P70190 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capza3P70190 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capza3P70190 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capza3P70190 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capza3P70190 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capza3P70190 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capza3P70190 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capza3P70190 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capza3P70190 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capza3P70190 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capza3P70190 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capza3P70190 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capza3P70190 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capza3P70190 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capza3P70190 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capza3P70190 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Capza3P70190 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capza3P70190 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capza3P70190 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capza3P70190 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capza3P70190 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capza3P70190 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capza3P70190 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capza3P70190 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capza3P70190 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capza3P70190 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capza3P70190 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capza3P70190 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capza3P70190 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capza3P70190 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capza3P70190 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capza3P70190 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capza3P70190 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capza3P70190 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capza3P70190 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Capza3P70190 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capza3P70190 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capza3P70190 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capza3P70190 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capza3P70190 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capza3P70190 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capza3P70190 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Capza3P70190 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capza3P70190 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capza3P70190 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capza3P70190 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capza3P70190 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capza3P70190 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capza3P70190 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capza3P70190 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms