Protein–RNA interactions for Protein: P63260

Actg1, Actin, cytoplasmic 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg1P63260 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Actg1P63260 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Actg1P63260 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Actg1P63260 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Actg1P63260 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actg1P63260 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actg1P63260 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actg1P63260 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actg1P63260 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actg1P63260 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actg1P63260 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actg1P63260 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms