Protein–RNA interactions for Protein: P63158

Hmgb1, High mobility group protein B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb1P63158 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmgb1P63158 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmgb1P63158 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmgb1P63158 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmgb1P63158 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmgb1P63158 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmgb1P63158 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmgb1P63158 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmgb1P63158 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmgb1P63158 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmgb1P63158 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmgb1P63158 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmgb1P63158 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmgb1P63158 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmgb1P63158 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmgb1P63158 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmgb1P63158 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmgb1P63158 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmgb1P63158 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hmgb1P63158 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hmgb1P63158 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hmgb1P63158 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hmgb1P63158 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hmgb1P63158 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hmgb1P63158 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hmgb1P63158 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hmgb1P63158 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Hmgb1P63158 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hmgb1P63158 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hmgb1P63158 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmgb1P63158 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmgb1P63158 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmgb1P63158 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmgb1P63158 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmgb1P63158 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmgb1P63158 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmgb1P63158 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmgb1P63158 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmgb1P63158 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmgb1P63158 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmgb1P63158 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmgb1P63158 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmgb1P63158 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmgb1P63158 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmgb1P63158 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmgb1P63158 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmgb1P63158 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmgb1P63158 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmgb1P63158 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmgb1P63158 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmgb1P63158 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmgb1P63158 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmgb1P63158 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmgb1P63158 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmgb1P63158 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmgb1P63158 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmgb1P63158 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmgb1P63158 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmgb1P63158 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmgb1P63158 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmgb1P63158 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmgb1P63158 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmgb1P63158 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmgb1P63158 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms