Protein–RNA interactions for Protein: P63040

Cplx1, Complexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cplx1P63040 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cplx1P63040 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cplx1P63040 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cplx1P63040 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cplx1P63040 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cplx1P63040 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cplx1P63040 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cplx1P63040 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cplx1P63040 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cplx1P63040 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cplx1P63040 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cplx1P63040 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cplx1P63040 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cplx1P63040 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cplx1P63040 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cplx1P63040 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cplx1P63040 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cplx1P63040 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cplx1P63040 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cplx1P63040 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cplx1P63040 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cplx1P63040 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cplx1P63040 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cplx1P63040 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cplx1P63040 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cplx1P63040 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cplx1P63040 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cplx1P63040 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cplx1P63040 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cplx1P63040 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cplx1P63040 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cplx1P63040 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cplx1P63040 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cplx1P63040 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cplx1P63040 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cplx1P63040 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cplx1P63040 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cplx1P63040 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cplx1P63040 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cplx1P63040 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Cplx1P63040 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cplx1P63040 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cplx1P63040 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cplx1P63040 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cplx1P63040 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cplx1P63040 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cplx1P63040 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cplx1P63040 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cplx1P63040 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cplx1P63040 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cplx1P63040 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cplx1P63040 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cplx1P63040 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cplx1P63040 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cplx1P63040 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cplx1P63040 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cplx1P63040 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cplx1P63040 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cplx1P63040 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cplx1P63040 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cplx1P63040 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cplx1P63040 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cplx1P63040 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cplx1P63040 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cplx1P63040 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cplx1P63040 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cplx1P63040 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cplx1P63040 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cplx1P63040 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cplx1P63040 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cplx1P63040 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cplx1P63040 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cplx1P63040 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cplx1P63040 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cplx1P63040 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cplx1P63040 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cplx1P63040 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cplx1P63040 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cplx1P63040 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cplx1P63040 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cplx1P63040 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cplx1P63040 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cplx1P63040 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cplx1P63040 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cplx1P63040 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cplx1P63040 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cplx1P63040 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cplx1P63040 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cplx1P63040 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cplx1P63040 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cplx1P63040 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cplx1P63040 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cplx1P63040 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cplx1P63040 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cplx1P63040 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cplx1P63040 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cplx1P63040 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cplx1P63040 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cplx1P63040 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cplx1P63040 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms