Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp3P63024 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vamp3P63024 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp3P63024 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms