Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga11P61622 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itga11P61622 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga11P61622 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga11P61622 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga11P61622 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Itga11P61622 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Itga11P61622 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga11P61622 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga11P61622 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga11P61622 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga11P61622 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga11P61622 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga11P61622 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga11P61622 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga11P61622 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga11P61622 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga11P61622 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga11P61622 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga11P61622 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga11P61622 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga11P61622 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga11P61622 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga11P61622 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga11P61622 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga11P61622 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga11P61622 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga11P61622 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga11P61622 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms