Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2d1P61080 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2d1P61080 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2d1P61080 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2d1P61080 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2d1P61080 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2d1P61080 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2d1P61080 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2d1P61080 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2d1P61080 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2d1P61080 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2d1P61080 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2d1P61080 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2d1P61080 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2d1P61080 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2d1P61080 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2d1P61080 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2d1P61080 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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