Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppfia3P60469 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppfia3P60469 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppfia3P60469 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppfia3P60469 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppfia3P60469 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppfia3P60469 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppfia3P60469 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppfia3P60469 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppfia3P60469 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppfia3P60469 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppfia3P60469 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ppfia3P60469 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppfia3P60469 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppfia3P60469 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppfia3P60469 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppfia3P60469 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppfia3P60469 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppfia3P60469 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppfia3P60469 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppfia3P60469 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppfia3P60469 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppfia3P60469 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppfia3P60469 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppfia3P60469 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppfia3P60469 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppfia3P60469 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppfia3P60469 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppfia3P60469 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppfia3P60469 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppfia3P60469 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppfia3P60469 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppfia3P60469 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppfia3P60469 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppfia3P60469 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppfia3P60469 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfia3P60469 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfia3P60469 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfia3P60469 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfia3P60469 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfia3P60469 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfia3P60469 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfia3P60469 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfia3P60469 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfia3P60469 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppfia3P60469 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppfia3P60469 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppfia3P60469 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppfia3P60469 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppfia3P60469 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppfia3P60469 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppfia3P60469 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms