Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tpm2P58774 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tpm2P58774 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tpm2P58774 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tpm2P58774 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tpm2P58774 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tpm2P58774 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpm2P58774 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpm2P58774 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpm2P58774 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpm2P58774 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tpm2P58774 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tpm2P58774 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tpm2P58774 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tpm2P58774 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpm2P58774 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpm2P58774 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpm2P58774 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpm2P58774 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpm2P58774 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpm2P58774 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpm2P58774 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpm2P58774 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpm2P58774 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpm2P58774 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpm2P58774 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpm2P58774 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpm2P58774 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpm2P58774 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpm2P58774 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpm2P58774 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpm2P58774 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpm2P58774 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tpm2P58774 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tpm2P58774 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tpm2P58774 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tpm2P58774 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tpm2P58774 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tpm2P58774 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tpm2P58774 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpm2P58774 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpm2P58774 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpm2P58774 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpm2P58774 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpm2P58774 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpm2P58774 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpm2P58774 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpm2P58774 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpm2P58774 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpm2P58774 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpm2P58774 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpm2P58774 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpm2P58774 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpm2P58774 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpm2P58774 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpm2P58774 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpm2P58774 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpm2P58774 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpm2P58774 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpm2P58774 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpm2P58774 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpm2P58774 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpm2P58774 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpm2P58774 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpm2P58774 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpm2P58774 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpm2P58774 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpm2P58774 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpm2P58774 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpm2P58774 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpm2P58774 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tpm2P58774 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tpm2P58774 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tpm2P58774 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tpm2P58774 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tpm2P58774 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tpm2P58774 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tpm2P58774 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tpm2P58774 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tpm2P58774 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tpm2P58774 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tpm2P58774 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpm2P58774 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpm2P58774 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpm2P58774 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpm2P58774 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpm2P58774 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpm2P58774 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpm2P58774 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tpm2P58774 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tpm2P58774 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tpm2P58774 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tpm2P58774 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tpm2P58774 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tpm2P58774 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tpm2P58774 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tpm2P58774 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tpm2P58774 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tpm2P58774 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tpm2P58774 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms