Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Strn4P58404 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Strn4P58404 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Strn4P58404 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Strn4P58404 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Strn4P58404 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Strn4P58404 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Strn4P58404 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Strn4P58404 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Strn4P58404 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Strn4P58404 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Strn4P58404 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Strn4P58404 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Strn4P58404 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Strn4P58404 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Strn4P58404 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Strn4P58404 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Strn4P58404 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Strn4P58404 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Strn4P58404 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Strn4P58404 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Strn4P58404 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Strn4P58404 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Strn4P58404 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Strn4P58404 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Strn4P58404 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Strn4P58404 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Strn4P58404 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Strn4P58404 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Strn4P58404 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Strn4P58404 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Strn4P58404 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Strn4P58404 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Strn4P58404 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Strn4P58404 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Strn4P58404 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Strn4P58404 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Strn4P58404 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Strn4P58404 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Strn4P58404 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Strn4P58404 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Strn4P58404 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Strn4P58404 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Strn4P58404 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Strn4P58404 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Strn4P58404 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Strn4P58404 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Strn4P58404 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Strn4P58404 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Strn4P58404 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Strn4P58404 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Strn4P58404 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Strn4P58404 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Strn4P58404 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Strn4P58404 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Strn4P58404 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Strn4P58404 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Strn4P58404 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Strn4P58404 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Strn4P58404 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Strn4P58404 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Strn4P58404 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Strn4P58404 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Strn4P58404 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Strn4P58404 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Strn4P58404 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Strn4P58404 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Strn4P58404 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Strn4P58404 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Strn4P58404 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Strn4P58404 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Strn4P58404 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Strn4P58404 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Strn4P58404 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Strn4P58404 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Strn4P58404 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Strn4P58404 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Strn4P58404 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Strn4P58404 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Strn4P58404 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Strn4P58404 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Strn4P58404 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Strn4P58404 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Strn4P58404 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Strn4P58404 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Strn4P58404 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Strn4P58404 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Strn4P58404 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Strn4P58404 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Strn4P58404 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Strn4P58404 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Strn4P58404 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Strn4P58404 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Strn4P58404 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Strn4P58404 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Strn4P58404 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Strn4P58404 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Strn4P58404 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Strn4P58404 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Strn4P58404 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms