Protein–RNA interactions for Protein: P58321

Uchl4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl4P58321 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Uchl4P58321 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uchl4P58321 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Uchl4P58321 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Uchl4P58321 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uchl4P58321 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Uchl4P58321 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Uchl4P58321 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uchl4P58321 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Uchl4P58321 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Uchl4P58321 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uchl4P58321 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uchl4P58321 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uchl4P58321 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uchl4P58321 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uchl4P58321 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uchl4P58321 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uchl4P58321 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uchl4P58321 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uchl4P58321 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uchl4P58321 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uchl4P58321 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uchl4P58321 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uchl4P58321 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uchl4P58321 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uchl4P58321 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uchl4P58321 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uchl4P58321 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uchl4P58321 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uchl4P58321 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uchl4P58321 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uchl4P58321 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uchl4P58321 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uchl4P58321 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Uchl4P58321 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uchl4P58321 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uchl4P58321 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uchl4P58321 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uchl4P58321 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uchl4P58321 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uchl4P58321 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uchl4P58321 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uchl4P58321 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uchl4P58321 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uchl4P58321 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uchl4P58321 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uchl4P58321 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uchl4P58321 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uchl4P58321 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms