Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Dpf3P58269 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dpf3P58269 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dpf3P58269 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dpf3P58269 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dpf3P58269 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dpf3P58269 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dpf3P58269 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Dpf3P58269 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dpf3P58269 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dpf3P58269 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dpf3P58269 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dpf3P58269 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dpf3P58269 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dpf3P58269 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Dpf3P58269 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dpf3P58269 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dpf3P58269 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dpf3P58269 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Dpf3P58269 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dpf3P58269 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dpf3P58269 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dpf3P58269 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dpf3P58269 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dpf3P58269 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dpf3P58269 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dpf3P58269 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dpf3P58269 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dpf3P58269 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dpf3P58269 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dpf3P58269 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dpf3P58269 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dpf3P58269 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dpf3P58269 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Dpf3P58269 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dpf3P58269 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dpf3P58269 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dpf3P58269 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dpf3P58269 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dpf3P58269 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dpf3P58269 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dpf3P58269 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dpf3P58269 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dpf3P58269 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dpf3P58269 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dpf3P58269 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dpf3P58269 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dpf3P58269 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dpf3P58269 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dpf3P58269 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dpf3P58269 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dpf3P58269 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms