Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp25P57080 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Usp25P57080 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp25P57080 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp25P57080 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp25P57080 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp25P57080 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp25P57080 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms