Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gsc2P56916 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gsc2P56916 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gsc2P56916 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gsc2P56916 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gsc2P56916 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gsc2P56916 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gsc2P56916 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gsc2P56916 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gsc2P56916 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gsc2P56916 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gsc2P56916 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gsc2P56916 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gsc2P56916 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gsc2P56916 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gsc2P56916 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gsc2P56916 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gsc2P56916 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gsc2P56916 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms