Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CtskP55097 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CtskP55097 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CtskP55097 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CtskP55097 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CtskP55097 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CtskP55097 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CtskP55097 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CtskP55097 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtskP55097 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtskP55097 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CtskP55097 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtskP55097 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtskP55097 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtskP55097 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CtskP55097 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CtskP55097 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtskP55097 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtskP55097 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtskP55097 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CtskP55097 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CtskP55097 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CtskP55097 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CtskP55097 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CtskP55097 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CtskP55097 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CtskP55097 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CtskP55097 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CtskP55097 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CtskP55097 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CtskP55097 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CtskP55097 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtskP55097 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtskP55097 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtskP55097 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtskP55097 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtskP55097 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtskP55097 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtskP55097 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtskP55097 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtskP55097 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtskP55097 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtskP55097 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtskP55097 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtskP55097 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtskP55097 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtskP55097 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtskP55097 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtskP55097 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtskP55097 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtskP55097 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtskP55097 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtskP55097 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtskP55097 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CtskP55097 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtskP55097 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtskP55097 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtskP55097 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CtskP55097 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CtskP55097 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CtskP55097 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CtskP55097 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CtskP55097 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtskP55097 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtskP55097 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtskP55097 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtskP55097 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtskP55097 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtskP55097 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtskP55097 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtskP55097 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtskP55097 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtskP55097 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtskP55097 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtskP55097 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtskP55097 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtskP55097 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtskP55097 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtskP55097 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtskP55097 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtskP55097 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtskP55097 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtskP55097 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtskP55097 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtskP55097 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtskP55097 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtskP55097 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtskP55097 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtskP55097 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtskP55097 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtskP55097 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtskP55097 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtskP55097 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtskP55097 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtskP55097 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtskP55097 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CtskP55097 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtskP55097 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CtskP55097 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtskP55097 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms