Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GemP55041 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GemP55041 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GemP55041 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GemP55041 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GemP55041 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
GemP55041 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GemP55041 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GemP55041 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GemP55041 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GemP55041 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GemP55041 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GemP55041 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GemP55041 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GemP55041 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GemP55041 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
GemP55041 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GemP55041 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GemP55041 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
GemP55041 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GemP55041 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GemP55041 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GemP55041 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GemP55041 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GemP55041 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GemP55041 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GemP55041 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GemP55041 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GemP55041 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GemP55041 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GemP55041 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GemP55041 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GemP55041 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GemP55041 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GemP55041 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GemP55041 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GemP55041 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GemP55041 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GemP55041 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GemP55041 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GemP55041 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GemP55041 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GemP55041 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GemP55041 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GemP55041 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GemP55041 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GemP55041 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GemP55041 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GemP55041 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GemP55041 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GemP55041 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GemP55041 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GemP55041 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GemP55041 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GemP55041 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GemP55041 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GemP55041 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GemP55041 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GemP55041 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GemP55041 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GemP55041 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GemP55041 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GemP55041 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GemP55041 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GemP55041 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GemP55041 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GemP55041 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GemP55041 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GemP55041 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GemP55041 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GemP55041 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GemP55041 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GemP55041 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GemP55041 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GemP55041 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GemP55041 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GemP55041 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GemP55041 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GemP55041 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GemP55041 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GemP55041 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GemP55041 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GemP55041 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GemP55041 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GemP55041 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GemP55041 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GemP55041 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GemP55041 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GemP55041 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GemP55041 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GemP55041 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GemP55041 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GemP55041 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GemP55041 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GemP55041 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GemP55041 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GemP55041 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GemP55041 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GemP55041 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GemP55041 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms