Protein–RNA interactions for Protein: P51827

Aff3, AF4/FMR2 family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff3P51827 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Aff3P51827 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aff3P51827 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aff3P51827 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aff3P51827 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aff3P51827 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aff3P51827 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aff3P51827 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aff3P51827 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aff3P51827 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aff3P51827 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aff3P51827 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aff3P51827 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Aff3P51827 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Aff3P51827 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Aff3P51827 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Aff3P51827 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Aff3P51827 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Aff3P51827 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aff3P51827 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aff3P51827 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aff3P51827 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aff3P51827 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aff3P51827 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aff3P51827 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Aff3P51827 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Aff3P51827 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Aff3P51827 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Aff3P51827 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Aff3P51827 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Aff3P51827 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Aff3P51827 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Aff3P51827 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aff3P51827 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aff3P51827 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aff3P51827 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aff3P51827 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aff3P51827 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aff3P51827 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aff3P51827 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aff3P51827 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aff3P51827 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aff3P51827 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aff3P51827 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aff3P51827 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Aff3P51827 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aff3P51827 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aff3P51827 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aff3P51827 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aff3P51827 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aff3P51827 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aff3P51827 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aff3P51827 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aff3P51827 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aff3P51827 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aff3P51827 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aff3P51827 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aff3P51827 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aff3P51827 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aff3P51827 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aff3P51827 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aff3P51827 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aff3P51827 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Aff3P51827 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aff3P51827 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aff3P51827 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aff3P51827 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aff3P51827 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aff3P51827 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aff3P51827 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aff3P51827 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aff3P51827 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aff3P51827 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aff3P51827 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aff3P51827 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aff3P51827 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aff3P51827 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aff3P51827 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aff3P51827 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aff3P51827 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aff3P51827 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aff3P51827 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aff3P51827 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aff3P51827 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Aff3P51827 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Aff3P51827 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Aff3P51827 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aff3P51827 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aff3P51827 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aff3P51827 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Aff3P51827 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aff3P51827 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aff3P51827 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aff3P51827 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aff3P51827 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aff3P51827 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aff3P51827 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aff3P51827 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aff3P51827 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Aff3P51827 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms