Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MipP51180 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MipP51180 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MipP51180 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MipP51180 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MipP51180 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MipP51180 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MipP51180 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MipP51180 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MipP51180 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MipP51180 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MipP51180 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MipP51180 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MipP51180 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MipP51180 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MipP51180 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MipP51180 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MipP51180 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MipP51180 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MipP51180 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MipP51180 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MipP51180 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MipP51180 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MipP51180 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MipP51180 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MipP51180 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MipP51180 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MipP51180 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MipP51180 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MipP51180 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MipP51180 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MipP51180 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MipP51180 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MipP51180 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MipP51180 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MipP51180 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MipP51180 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MipP51180 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MipP51180 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
MipP51180 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MipP51180 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MipP51180 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MipP51180 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MipP51180 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MipP51180 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MipP51180 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MipP51180 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MipP51180 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MipP51180 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MipP51180 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MipP51180 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MipP51180 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MipP51180 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MipP51180 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MipP51180 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MipP51180 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MipP51180 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MipP51180 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MipP51180 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MipP51180 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MipP51180 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MipP51180 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MipP51180 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MipP51180 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MipP51180 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MipP51180 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MipP51180 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MipP51180 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MipP51180 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MipP51180 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MipP51180 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MipP51180 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MipP51180 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MipP51180 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MipP51180 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MipP51180 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MipP51180 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MipP51180 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MipP51180 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MipP51180 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MipP51180 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MipP51180 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MipP51180 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MipP51180 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MipP51180 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MipP51180 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MipP51180 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MipP51180 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MipP51180 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MipP51180 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MipP51180 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MipP51180 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MipP51180 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MipP51180 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MipP51180 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MipP51180 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MipP51180 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MipP51180 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MipP51180 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MipP51180 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms