Protein–RNA interactions for Protein: P50707

Defa9, Alpha-defensin 9, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa9P50707 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa9P50707 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa9P50707 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa9P50707 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defa9P50707 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa9P50707 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms