Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LtbrP50284 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LtbrP50284 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LtbrP50284 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LtbrP50284 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LtbrP50284 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LtbrP50284 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LtbrP50284 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LtbrP50284 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LtbrP50284 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LtbrP50284 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LtbrP50284 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LtbrP50284 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LtbrP50284 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LtbrP50284 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LtbrP50284 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LtbrP50284 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LtbrP50284 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LtbrP50284 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LtbrP50284 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LtbrP50284 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LtbrP50284 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LtbrP50284 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LtbrP50284 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LtbrP50284 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LtbrP50284 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LtbrP50284 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LtbrP50284 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LtbrP50284 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LtbrP50284 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LtbrP50284 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LtbrP50284 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LtbrP50284 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LtbrP50284 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LtbrP50284 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LtbrP50284 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LtbrP50284 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LtbrP50284 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LtbrP50284 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LtbrP50284 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LtbrP50284 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LtbrP50284 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LtbrP50284 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LtbrP50284 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LtbrP50284 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LtbrP50284 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LtbrP50284 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LtbrP50284 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LtbrP50284 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LtbrP50284 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LtbrP50284 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LtbrP50284 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LtbrP50284 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LtbrP50284 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LtbrP50284 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LtbrP50284 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LtbrP50284 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LtbrP50284 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms