Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cxcl5P50228 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcl5P50228 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms