Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epb42P49222 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Epb42P49222 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Epb42P49222 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Epb42P49222 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Epb42P49222 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Epb42P49222 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Epb42P49222 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Epb42P49222 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Epb42P49222 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Epb42P49222 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Epb42P49222 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Epb42P49222 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Epb42P49222 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Epb42P49222 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Epb42P49222 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Epb42P49222 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Epb42P49222 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Epb42P49222 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Epb42P49222 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Epb42P49222 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Epb42P49222 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Epb42P49222 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Epb42P49222 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Epb42P49222 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Epb42P49222 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Epb42P49222 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Epb42P49222 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Epb42P49222 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Epb42P49222 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Epb42P49222 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Epb42P49222 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Epb42P49222 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Epb42P49222 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Epb42P49222 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Epb42P49222 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Epb42P49222 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms