Protein–RNA interactions for Protein: P48758

Cbr1, Carbonyl reductase [NADPH] 1, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbr1P48758 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cbr1P48758 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbr1P48758 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms