Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edn3P48299 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edn3P48299 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edn3P48299 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edn3P48299 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Edn3P48299 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edn3P48299 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Edn3P48299 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Edn3P48299 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Edn3P48299 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Edn3P48299 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Edn3P48299 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Edn3P48299 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Edn3P48299 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Edn3P48299 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Edn3P48299 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Edn3P48299 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edn3P48299 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edn3P48299 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edn3P48299 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Edn3P48299 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.1 ms