Protein–RNA interactions for Protein: P43135

Nr2f2, COUP transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f2P43135 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr2f2P43135 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nr2f2P43135 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nr2f2P43135 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nr2f2P43135 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nr2f2P43135 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nr2f2P43135 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nr2f2P43135 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms