Protein–RNA interactions for Protein: P43006

Slc1a2, Excitatory amino acid transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a2P43006 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc1a2P43006 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc1a2P43006 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc1a2P43006 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc1a2P43006 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc1a2P43006 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc1a2P43006 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc1a2P43006 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc1a2P43006 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc1a2P43006 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc1a2P43006 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc1a2P43006 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc1a2P43006 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc1a2P43006 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc1a2P43006 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc1a2P43006 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms