Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csf3rP40223 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csf3rP40223 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csf3rP40223 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csf3rP40223 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csf3rP40223 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csf3rP40223 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csf3rP40223 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csf3rP40223 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csf3rP40223 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Csf3rP40223 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms