Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PpargP37238 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PpargP37238 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PpargP37238 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PpargP37238 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PpargP37238 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PpargP37238 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PpargP37238 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PpargP37238 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PpargP37238 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PpargP37238 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PpargP37238 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PpargP37238 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PpargP37238 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PpargP37238 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PpargP37238 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PpargP37238 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PpargP37238 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PpargP37238 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PpargP37238 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PpargP37238 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PpargP37238 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PpargP37238 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PpargP37238 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PpargP37238 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PpargP37238 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PpargP37238 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PpargP37238 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PpargP37238 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PpargP37238 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PpargP37238 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PpargP37238 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PpargP37238 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PpargP37238 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PpargP37238 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PpargP37238 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PpargP37238 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PpargP37238 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PpargP37238 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PpargP37238 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PpargP37238 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PpargP37238 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PpargP37238 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PpargP37238 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PpargP37238 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PpargP37238 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PpargP37238 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PpargP37238 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PpargP37238 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PpargP37238 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PpargP37238 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PpargP37238 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PpargP37238 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PpargP37238 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PpargP37238 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PpargP37238 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PpargP37238 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PpargP37238 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PpargP37238 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PpargP37238 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PpargP37238 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PpargP37238 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PpargP37238 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PpargP37238 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PpargP37238 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PpargP37238 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PpargP37238 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PpargP37238 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PpargP37238 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PpargP37238 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PpargP37238 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PpargP37238 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PpargP37238 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PpargP37238 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PpargP37238 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PpargP37238 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PpargP37238 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PpargP37238 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PpargP37238 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PpargP37238 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PpargP37238 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PpargP37238 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PpargP37238 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PpargP37238 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PpargP37238 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PpargP37238 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PpargP37238 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PpargP37238 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PpargP37238 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PpargP37238 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PpargP37238 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PpargP37238 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PpargP37238 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PpargP37238 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PpargP37238 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PpargP37238 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PpargP37238 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PpargP37238 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PpargP37238 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PpargP37238 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.6 ms