Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pola1P33609 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pola1P33609 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pola1P33609 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pola1P33609 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pola1P33609 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pola1P33609 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pola1P33609 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pola1P33609 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pola1P33609 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pola1P33609 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pola1P33609 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pola1P33609 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pola1P33609 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pola1P33609 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pola1P33609 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pola1P33609 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Pola1P33609 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Pola1P33609 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Pola1P33609 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pola1P33609 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pola1P33609 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pola1P33609 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pola1P33609 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pola1P33609 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pola1P33609 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Pola1P33609 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pola1P33609 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pola1P33609 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pola1P33609 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pola1P33609 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pola1P33609 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pola1P33609 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pola1P33609 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pola1P33609 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pola1P33609 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pola1P33609 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pola1P33609 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pola1P33609 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Pola1P33609 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pola1P33609 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pola1P33609 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pola1P33609 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pola1P33609 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Pola1P33609 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pola1P33609 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pola1P33609 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pola1P33609 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pola1P33609 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pola1P33609 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Pola1P33609 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pola1P33609 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pola1P33609 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pola1P33609 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pola1P33609 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Pola1P33609 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pola1P33609 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pola1P33609 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pola1P33609 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pola1P33609 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pola1P33609 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pola1P33609 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pola1P33609 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pola1P33609 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pola1P33609 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pola1P33609 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pola1P33609 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pola1P33609 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pola1P33609 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pola1P33609 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pola1P33609 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pola1P33609 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pola1P33609 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pola1P33609 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Pola1P33609 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pola1P33609 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pola1P33609 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pola1P33609 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pola1P33609 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pola1P33609 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pola1P33609 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pola1P33609 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pola1P33609 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pola1P33609 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pola1P33609 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pola1P33609 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pola1P33609 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pola1P33609 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pola1P33609 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pola1P33609 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pola1P33609 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pola1P33609 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pola1P33609 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pola1P33609 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pola1P33609 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pola1P33609 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pola1P33609 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pola1P33609 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pola1P33609 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pola1P33609 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms