Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nedd1P33215 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nedd1P33215 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nedd1P33215 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nedd1P33215 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nedd1P33215 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Nedd1P33215 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nedd1P33215 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nedd1P33215 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nedd1P33215 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nedd1P33215 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nedd1P33215 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nedd1P33215 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nedd1P33215 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nedd1P33215 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nedd1P33215 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nedd1P33215 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nedd1P33215 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nedd1P33215 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nedd1P33215 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nedd1P33215 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nedd1P33215 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nedd1P33215 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nedd1P33215 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nedd1P33215 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nedd1P33215 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nedd1P33215 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nedd1P33215 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nedd1P33215 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nedd1P33215 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nedd1P33215 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nedd1P33215 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nedd1P33215 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nedd1P33215 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nedd1P33215 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nedd1P33215 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nedd1P33215 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nedd1P33215 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nedd1P33215 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nedd1P33215 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nedd1P33215 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nedd1P33215 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nedd1P33215 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nedd1P33215 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nedd1P33215 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nedd1P33215 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nedd1P33215 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nedd1P33215 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nedd1P33215 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nedd1P33215 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nedd1P33215 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nedd1P33215 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nedd1P33215 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms