Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxc5P32043 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxc5P32043 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxc5P32043 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxc5P32043 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxc5P32043 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxc5P32043 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxc5P32043 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxc5P32043 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxc5P32043 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxc5P32043 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxc5P32043 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxc5P32043 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxc5P32043 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxc5P32043 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxc5P32043 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxc5P32043 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxc5P32043 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxc5P32043 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxc5P32043 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxc5P32043 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxc5P32043 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxc5P32043 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxc5P32043 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxc5P32043 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxc5P32043 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxc5P32043 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxc5P32043 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxc5P32043 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxc5P32043 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxc5P32043 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxc5P32043 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxc5P32043 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxc5P32043 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxc5P32043 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxc5P32043 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxc5P32043 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxc5P32043 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxc5P32043 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxc5P32043 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxc5P32043 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc5P32043 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms