Protein–RNA interactions for Protein: P29416

Hexa, Beta-hexosaminidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HexaP29416 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HexaP29416 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HexaP29416 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HexaP29416 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HexaP29416 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HexaP29416 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HexaP29416 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HexaP29416 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HexaP29416 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HexaP29416 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HexaP29416 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HexaP29416 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HexaP29416 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HexaP29416 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HexaP29416 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HexaP29416 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HexaP29416 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HexaP29416 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HexaP29416 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HexaP29416 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HexaP29416 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HexaP29416 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HexaP29416 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HexaP29416 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HexaP29416 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HexaP29416 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HexaP29416 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HexaP29416 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HexaP29416 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HexaP29416 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HexaP29416 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HexaP29416 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HexaP29416 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HexaP29416 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HexaP29416 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HexaP29416 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HexaP29416 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HexaP29416 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HexaP29416 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HexaP29416 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HexaP29416 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HexaP29416 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HexaP29416 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HexaP29416 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HexaP29416 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HexaP29416 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HexaP29416 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HexaP29416 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HexaP29416 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HexaP29416 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HexaP29416 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HexaP29416 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HexaP29416 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HexaP29416 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HexaP29416 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HexaP29416 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HexaP29416 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HexaP29416 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HexaP29416 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HexaP29416 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HexaP29416 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HexaP29416 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HexaP29416 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HexaP29416 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HexaP29416 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HexaP29416 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HexaP29416 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HexaP29416 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HexaP29416 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HexaP29416 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HexaP29416 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HexaP29416 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HexaP29416 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HexaP29416 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HexaP29416 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HexaP29416 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HexaP29416 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HexaP29416 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HexaP29416 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HexaP29416 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HexaP29416 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HexaP29416 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HexaP29416 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HexaP29416 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HexaP29416 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HexaP29416 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HexaP29416 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HexaP29416 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HexaP29416 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HexaP29416 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HexaP29416 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HexaP29416 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HexaP29416 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HexaP29416 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HexaP29416 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HexaP29416 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HexaP29416 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HexaP29416 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HexaP29416 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HexaP29416 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms